L'Égypte a été le premier pays africain à confirmer le premier cas de covid19 en février 2020. Le Nigéria a également annoncé les premiers cas de coronavirus. Selon le New York Times, la plupart des cas identifiés en Afrique, ne provenaient pas de Chine mais d'Europe et des États-Unis. L’Afrique souffre de pénuries d'équipement et budgétaires, d’un manque de formation des agents de santé et de problèmes de transfert d'informations. D'un autre côté, on craint que l'épidémie de corona affecte gravement l'économie du continent. Les pays africains ont été les plus durement touchés par l’épidémie qui a sévi en Chine, à cause de la forte présence de la Chine sur leurs marchés et dans leur économie, et qui pourrait entraîner une baisse des revenus de 79 milliards de dollars pour l'ensemble du continent.

Le 19 avril, l'Algérie comptait le plus grand nombre de victimes avec 375 victimes du Corona, et l'Afrique du Sud, 3 150 cas, c’est à dire le plus grand nombre parmi les pays africains. Le nombre de cas en Afrique du Sud, qui comptait le plus grand nombre de cas, a fortement diminué après la mise en œuvre de lois strictes de confinement, mais le nombre de cas dans d'autres pays comme le Burkina Faso, la République démocratique du Congo et l'Algérie a dépassé les prévisions.

Cette situation a créé des problèmes imprévisibles pour les économies de nombreux pays africains particulièrement dans les zones urbaines à croissance rapide. Selon la Commission économique des Nations Unies pour l'Afrique (CEA), les villes africaines comptent 600 millions habitants et représentent plus de 50% du PIB du continent. Dans des pays comme le Botswana, l'Ouganda, la Tunisie et le Kenya, la situation dépasse les 70%. Un tiers du produit intérieur brut (31%) provient en moyenne des grandes villes africaines. Les effets de l'épidémie de corona seront graves dans les zones urbaines, a indiqué l'Agence. En raison des secteurs économiques basés sur la production et les services, qui représentent actuellement 64% du produit intérieur brut de l'Afrique, l’épidémie pourrait conduire à des pertes importantes d'emplois manufacturiers.

Les problèmes économiques ont conduit certains pays africains à rechercher des prêts auprès des organisations internationales. Par exemple, la chute du prix du pétrole a conduit le gouvernement nigérian qui est un des plus grands exportateurs de pétrole au monde, à solliciter 7 milliards de dollars de financement d'urgence auprès du Fonds monétaire international (FMI) et de la Banque mondiale. La situation est similaire dans d'autres pays africains comme l'Algérie et l'Angola, et le Kenya est en pourparlers pour obtenir une aide de 1,2 milliard de dollars de la Banque mondiale et du Fonds monétaire international. L'économie du Kenya était déjà sous pression mais le Corona a complètement bouleversé l'économie du pays largement basée sur l'industrie du tourisme.

L'impact économique de l’épidémie ne se limitera pas à l'industrie africaine et il est à craindre que les soins de santé soient complètement éclipsés.

La décision de l'administration Trump de réduire le budget de l'Organisation mondiale de la santé a porté un coup sévère aux efforts des gouvernements africains dans leur lutte contre le Corona.

« Le lavage des mains et le confinement peuvent être difficiles dans certaines régions d'Afrique. Un confinement peut ne pas être possible et avec la propagation de maladies telles que le paludisme, le VIH, la tuberculose et le choléra, les problèmes pour faire face au corona, vont probablement s'intensifier », a déclaré Matshidiso Moeti, un des responsables de l'Organisation mondiale de la santé.

Un responsable régional de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a également déclaré que le nombre de cas de coronavirus en Afrique, pourrait atteindre les 10 millions dans les trois ou six mois.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a aidé de nombreux pays africains à mettre en place des laboratoires pour des tests de corona. De nombreuses mesures préventives ont été prises dans divers pays africains, notamment des restrictions de voyage, des annulations de vols, des annulations de programmes sportifs et sociaux, la fermeture des écoles et des frontières.

Cependant, la suppression de l’aide des États-Unis à l'Organisation mondiale de la santé, a rendu difficile l'aide aux pays et pourrait nuire le plus aux pays africains. Washington est le plus grand donateur de l'Organisation mondiale de la santé qui en plus de lutter contre certaines maladies, renforce les systèmes de santé nationaux. Les États-Unis ont versé plus de 400 millions de dollars en 2019 ce qui représentait environ 15% de son budget.

Cette décision a incité le plus grand centre de recherche d'Afrique à lutter contre la maladie. Ohn Nkengasong, directeur du CDC, Centre africain de contrôle des maladies, a exprimé ses préoccupations après la décision des États-Unis de réduire le budget de l'Organisation mondiale de la santé sous prétexte d’une mauvaise gestion.

 « Cela affectera la capacité des États membres (Union africaine) à recevoir le soutien de cet organisme international », a-t-il déclaré.